全基因組測序分析鎖定痢疾

要想有效控製傳染病，就必須對病原體的“隱私”有更為深入的剖析。由**預防控製中心病毒病預防控製所等6個單位*近完成的《痢疾杆菌全基因組序列測定與分析》科研課題，從分子水平對我國流行的痢**原菌優勢菌株——福氏2a痢疾杆菌301株的致病機理和耐藥機製進行了研究，取得了一係列具有原創性的科研成果。

主持此項研究的金奇教授等15位科研人員，采用當前*先進的技術，構建了4萬多個基因組片段克隆組成的全基因組Shotgun完全隨機文庫、限製性內切酶半定向隨機文庫和BAC文庫等三套基因組文庫。他們采用一端測序的步驟，測定了30Mb（兆堿基對）以上的序列，完成了包括毒力大質粒在內的全基因組序列測定和分析。研究人員通過基因組功能注釋研究，發現痢疾杆菌301株是目前已知含IS序列*多的微生物，顯示該基因組異常活躍。而且，該菌株的比較基因組學分析也提示，301株的染色體上存有多個大片段的倒置和移位，這可能是影響**的侵襲與致病性的重要因素。

更有意義的是，研究者經功能注釋與比較基因組學研究，共獲得了痢疾杆菌301株500多個特異的新基因，其中有近200個迄今未見報道。他們還利用生物信息學方法，對新基因進行結構模擬和功能預測，先後獲得了數十個編碼外膜蛋白的基因，並以此作為有效**的組分和**靶位的候選蛋白，從而為研製新型疫苗和新藥奠定了基礎。

這項研究從基因組水平上，初步揭示了痢疾與大腸杆菌的進化關係，並獲得了數十個各菌株特異性的“基因組島”。由於這之中的多個“基因組島”分別與各自重要物質的代謝及其毒力相關，故為研究痢疾杆菌的毒力進化和致病機理，尤其為痢疾的有效防治提供了科學依據。

• 眾說風雲 (已有0條評論)